（令和７年４月１日現在）
| 役職 | 分掌 | 氏名 | 現職 |
| 理 事 長 | 近野 真一 | ||
| 副理事長 | 石川 義弘 | 学長 | |
| 理 事 | 教育・研究 (医学群) |
稲葉 裕 | 副学長 |
| 理 事 | 医療・病院経営 | 遠藤 格 | 附属病院長 |
| 理 事 | 教育・研究 (国際総合科学群) |
橘 勝 | 副学長 |
| 理 事 | 法人経営 | 松井 達也 | 事務局長 |
| 理 事 (非常勤) |
経営全般 | 井伊 雅子 | 一橋大学 大学院 経済研究科 教授 一橋大学 大学院 国際・公共政策大学院 教授 |
| 理 事 (非常勤） |
経営全般 | 原口 淳 | 横浜市立大学後援会 会長 |
| 理 事 (非常勤） |
経営全般 | 原田 一之 | 京浜急行電鉄株式会社 取締役会長（代表取締役） |
| 理 事 (非常勤） |
経営全般 | 藤井 謙宗 | 株式会社横浜スタジアム 代表取締役社長 |
| 理 事 (非常勤） |
経営全般 | 増住 敏彦 | |
| 監 事 | 岡 研三 | 公認会計士・公認不正検査士 | |
| 監 事 | 左部 明宏 | 弁護士 |
