共同利用・共同研究拠点「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」

「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」

拠点の概要

横浜市立大学先端医科学研究センターは、平成30年4月1日より共同利用・共同研究拠点「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」として文部科学省に認定され、令和4年度より「特色ある共同研究拠点の整備の推進事業～機能強化支援～」に採択されました。
これまで本センターで培ってきた、各種オミックスやバイオインフォマティクスの解析設備と技術を他大学・研究所・企業に提供し、遺伝子発現制御研究に関する医学研究を推進しています。

生命現象の核をなし、疾患病態の理解にも重要な遺伝子発現制御に関する研究には、様々な網羅的な分子情報をまとめた情報（オミックス情報）および膨大なデータを統合的に解析するバイオインフォマティクスの技術が不可欠です。本拠点では、RNA-seqやChIP-seq、単一細胞RNA-seqなどの次世代シーケンサー解析や、質量分析法などの共同利用・共同研究を広く進めることで、遺伝子発現制御に関する医学研究の発展に貢献します。

【認定概要】
　大学・研究施設名　：　横浜市立大学先端医科学研究センター
　代　　表　　者　：　山口　由衣（先端医科学研究センターセンター長）
　運営委員長：田村　智彦（免疫学教授）
　拠　点　名　称　：　マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点
　研　究　分　野　：　医学・生物系
　認　定　期　間　：　平成30年4月1日～令和13年3月31日
　参　　　　　考　：　http://www.mext.go.jp/a_menu/kyoten/1397790.htm 　(文部科学省ホームページ)

共同研究について

本拠点では他大学・研究所・企業を対象に、遺伝子発現に関わる重要な医学的・生物学的課題について、高度な解析技術による深い分子機構の理解に基づき新たな概念に結びつく共同研究を公募します。

共同研究の成果を学術論文として発表される場合は、謝辞に本拠点の支援による旨の文章を記載してください。

文例は以下を参考にしてください。
【和文】
本研究成果は横浜市立大学先端医科学研究センターにおける文部科学省特色ある共同利用・共同研究拠点支援プログラム JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149ならびにJPMXP0724020288の支援を受けて得られたものです。
【英文】
This research was supported by MEXT Promotion of Distinctive Joint Usage/Research Center Support Program Grant Numbers JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149 and JPMXP0724020288 at the Advanced Medical Research Center, Yokohama City University.

体系的番号は以下を参考にしてください。
H30〜R2年度：JPMXP0618217493
R4年度：JPMXP0622717006
R5年度：JPMXP0723833149
R6～R8年度：JPMXP0724020288

共同研究課題実績

■ 令和７年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	東北大学大学院医学系研究科	BACH2欠損B細胞におけるIRF4蓄積制御機構の解明
2	熊本大学国際先端医学研究機構	脳—腸管連関の制御による新たな骨髄移植法の確立
3	国立循環器病研究センター研究所	難治性心疾患の病態伸展および予後改善を規定する因子の探索的研究
4	群馬大学未来先端研究機構	RNAポリメラーゼII変異に依存したクロマチン構造変換による腫瘍増悪化機序の解明
5	東京薬科大学生命科学部	制御性単球の炎症抑制および組織修復機序の解析
6	東北大学大学院医学系研究科	転写因子BACH1による膵臓癌微小環境制御の解明
7	東京薬科大学生命科学部	転写因子C/EBPβによる単球・樹状細胞系統の分化制御機構の解明
8	東京大学医科学研究所	胃食道接合部癌の発生機序の解明
9	神戸大学大学院医学研究科	中枢神経系原発悪性リンパ腫に対する空間的トランスクリプトーム解析
10	神奈川県立がんセンター臨床研究所	がん播種巣の空間的遺伝子解析によるがん脂肪相互作用の解明と新規治療標的の探索
11	熊本大学大学院生命科学研究部	希少腎癌の細胞分化と細胞可塑性に着目した腎腫瘍化機構の解析研究
12	北里大学医学部	転写因子IRF5 活性化を指標とした全身性エリテマトーデス患者の遺伝子発現プロファイル解析

■ 令和６年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	東北大学大学院医学系研究科	転写因子BACH2欠損によるB細胞クロマチン構造異常の解明
2	東京大学医科学研究所	胃食道接合部癌の発生機序の解明
3	東京薬科大学生命科学部	制御性単球の炎症抑制および組織修復機序の解析
4	東京大学医科学研究所	造血幹細胞からの血小板バイパス分化を制御するカルシウムシグナル伝達の解明
5	神戸大学大学院医学研究科	中枢神経系原発悪性リンパ腫に対する空間的トランスクリプトーム解析
6	国立循環器病研究センター研究所	難治性心疾患の病態進展および予後改善を規定する因子の探索的研究
7	群馬大学未来先端研究機構	腫瘍増殖を抑制する転写ユニティー機構の解明
8	国立国際医療研究センター研究所	骨髄ニッチの修復過程を制御するメカニズムの解析
9	神奈川県立がんセンター臨床研究所	がん播種巣の空間的遺伝子解析によるがん脂肪相互作用の解明と新規治療標的の探索
10	東京大学定量生命科学研究所	免疫応答の強力な活性化を引き起こす新たな細胞ストレス/細胞死の機構解明を目的としたオミックス解析
11	熊本大学大学院生命科学研究部	希少腎癌の細胞分化と細胞可塑性に着目した腎腫瘍化機構の解析研究
12	神戸大学大学院医学研究科	クロマチン動態が司る造血幹細胞の免疫応答と分化ポテンシャル
13	東京薬科大学生命科学部	新規単球の分化制御機構の解明

■ 令和５年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	東京女子医科大学実験動物研究所	エピゲノムとシグナル制御異常の協調による骨髄系腫瘍発症機構の解明
2	東海大学医学部	心臓性突然死における心筋タンパク質の異方的発現プロファイリング
3	大阪大学大学院医学系研究科	腫瘍増殖を抑制する転写ユニティー機構の解明
4	神戸大学大学院医学研究科	クロマチン動態による造血幹細胞の免疫応答制御機構
5	奈良県立医科大学医学部	多能性幹細胞の未分化状態から分化状態への遷移制御機構の解析
6	東京女子医科大学医学部	アレルギー感作機序の解明
7	熊本大学国際先端医学研究機構	選択的 mTORシグナル調節による、γδT細胞分化誘導機構の解明と抗腫瘍効果への応用
8	群馬大学生体調節研究所	膵島および肝臓の時間空間的単細胞解析による代謝疾患の病態解明
9	東北大学大学院医学系研究科	BACH2機能不全による形質細胞分化異常の全容解明
10	北里大学理学部	哺乳類における生殖細胞の性分化開始機構の解明
11	東京薬科大学生命科学部	新規単球の分化制御機構の解明
12	群馬大学生体調節研究所	新規エーラスダンロス症候群原因遺伝子Zip13が発現する筋間質細胞はどのようにして骨格筋形成と機能維持に関わるか？
13	東京薬科大学生命科学部	好中球様単球による炎症疾患の病態形成機構の解析

■令和４年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	群馬大学生体調節研究所	膵β 細胞量を規定する機能的遺伝子の同定による膵島機能制御
2	国立国際医療研究センター	ヒト膵島細胞の性状解析
3	大阪大学大学院医学系研究科	腫瘍増殖を抑制する転写ユニティー機構の解明
4	東京薬科大学生命科学部	好中球様単球の分化機構と、炎症疾患の病態形成における役割の解析
5	東京女子医科大学医学部	肺血管-上皮三次元イメージング法の開発
6	国立国際医療研究センター研究所	神経シグナルが造血幹細胞ホーミングを制御するメカニズムの解析
7	熊本大学国際先端医学研究機構	選択的 mTORシグナル調節による、γδT細胞分化誘導機構の解明と抗腫瘍効果への応用
8	北里大学理学部	公共データベースのトランスクリプトームデータを使った、新規遺伝子相互作用の探索プログラムの開発
9	東京薬科大学生命科学部	新規単球の分化制御機構の解明
10	神奈川県立がんセンター臨床研究所	エピゲノム解析を用いた膵癌微小環境の相互作用に関する探索的研究

■令和３年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	熊本大学国際先端医学研究機構	生体由来微少細胞を用いたクロマチンプロファイル解析
2	国立がん研究センター研究所	白血病がん遺伝子MLL-AF4の発現制御機構の解明
3	群馬大学生体調節研究所	ヒトおよびマウス膵島細胞の単一細胞解析による内分泌・増殖制御機構の解明
4	東海大学医学部	cccDNAに結合する新規反復配列によるヒストン修飾を介したHBV感染制御

■令和２年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	大阪大学大学院医学系研究科	RNAポリメラーゼⅡ変異に依存したクロマチン構造変換による腫瘍増悪化機序の解明
2	北里大学理学部	SWI/SNF クロマチンリモデリング複合体による生殖細胞の性分化制御機構
3	東海大学医学部	cccDNA(covalently closed circular DNA)に結合する新規宿主RNA機能解析
4	国立がん研究センター研究所	急性骨髄性白血病に必須なHOXA遺伝子の発現制御の解析
5	熊本大学国際先端医学研究機構	細胞内代謝調節によるT細胞分化制御機構の解明
6	国立国際医療研究センター研究所	ストレスが負荷された経験を造血幹細胞が記憶するメカニズムの理解
7	東京薬科大学生命科学部	制御性単球・マクロファージの分化機構解明とその臨床応用
8	東京大学医科学研究所	DNAバーコードを用いた造血幹細胞の非対称分裂の解析
9	神戸医療産業都市推進機構先端医療研究センター	造血器腫瘍における骨髄微小環境の解析

■平成31年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	東海大学医学部	マルチオミクスを活用した新規プロテオーム解析技術の創出
2	熊本大学国際先端医科学研究機構	細胞内代謝調節によるT細胞分化制御機構の解明
3	北里大学理学部	細胞分化において遺伝子発現を至適化するエンハンサー制御機構の解明
4	東京大学医科学研究所	ライフコースにおける造血幹細胞特性の統合的理解
5	東京薬科大学生命科学部	炎症抑制単球・マクロファージの文化制御機構解明
6	神戸大学医学部	中枢神経原発悪性リンパ腫における発がんの分子機構の解明
7	大阪大学医学部	RNAポリメラーゼⅡ変異に依存したクロマチン構造変換による腫瘍増悪化機序の解明
8	神奈川県立がんセンター	高精度なクリニカルシークエンスを目指した膵癌のゲノムとがん微小環境の統合理解
9	国立国際医療研究センター研究所	造血幹細胞成熟過程の単一細胞レベルの特徴と多様性の変容の理解

■平成30年度共同研究

	共同研究者所属機関	研究課題名称
1	北里大学理学部	細胞分化において遺伝子発現を至適化するエンハンサー間相互作用の解析
2	民間事業者(製薬企業)	<共同研究者の希望により非公開>
3	東京薬科大学生命科学部	炎症抑制性単球・マクロファージの分化制御機構解明を目指して
4	国立国際医療研究センター	骨髄血管内皮細胞の成熟に伴う単一細胞レベルの多様性変化の理解
5	東京工業大学生命理工学院	転写終結部位の制御機構解明に向けたゲノムワイド解析
6	熊本大学国際先端医学研究機構	融合TFE3による発がん分子機構の解明
7	関西学院大学理工学部	胚性ゲノム活性化を保証するエピゲノム構造の解明
8	東京薬科大学生命科学部	クローン造血の血球クローン拡大制御機構の解明