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共同利用・共同研究拠点「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」

共同利用・共同研究拠点『マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点』空間オミックス解析設備試行共同利用モニターのお知らせ

横浜市立大学先端医科学研究センター共同利用・共同研究拠点「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」では、空間オミックス解析設備の本格的な共同利用開始に向けて、運用体制及び技術支援体制の検証を目的とした共同利用モニター(試行共同利用)を実施します。

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「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」

拠点の概要

横浜市立大学先端医科学研究センターは、平成30年4月1日より共同利用・共同研究拠点「マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点」として文部科学省に認定され、令和4年度より「特色ある共同研究拠点の整備の推進事業~機能強化支援~」に採択されました。
これまで本センターで培ってきた、各種オミックスやバイオインフォマティクスの解析設備と技術を他大学・研究所・企業に提供し、遺伝子発現制御研究に関する医学研究を推進しています。

生命現象の核をなし、疾患病態の理解にも重要な遺伝子発現制御に関する研究には、様々な網羅的な分子情報をまとめた情報(オミックス情報)および膨大なデータを統合的に解析するバイオインフォマティクスの技術が不可欠です。本拠点では、RNA-seqやChIP-seq、単一細胞RNA-seqなどの次世代シーケンサー解析や、質量分析法などの共同利用・共同研究を広く進めることで、遺伝子発現制御に関する医学研究の発展に貢献します。


【認定概要】
 大学・研究施設名 : 横浜市立大学先端医科学研究センター
 代   表    者 : 山本 哲哉(先端医科学研究センター センター長)
 運   営   委   員   長 :   田村 智彦(免疫学 教授)
 拠  点  名  称 : マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点
 研  究  分  野 : 医学・生物系
 認  定  期  間 : 平成30年4月1日~令和13年3月31日
 参        考 : http://www.mext.go.jp/a_menu/kyoten/1397790.htm  (文部科学省ホームページ)
 
 

共同研究について

本拠点では他大学・研究所・企業を対象に、遺伝子発現に関わる重要な医学的・生物学的課題について、高度な解析技術による深い分子機構の理解に基づき新たな概念に結びつく共同研究を公募します。

共同研究の成果を学術論文として発表される場合は、謝辞に本拠点の支援による旨の文章を記載してください。

文例は以下を参考にしてください。
【和文】
本研究成果は横浜市立大学先端医科学研究センターにおける文部科学省特色ある共同利用・共同研究拠点支援プログラム JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149ならびにJPMXP0724020288の支援を受けて得られたものです。
【英文】
This research was supported by MEXT Promotion of Distinctive Joint Usage/Research Center Support Program Grant Numbers JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149 and JPMXP0724020288 at the Advanced Medical Research Center, Yokohama City University.

体系的番号は以下を参考にしてください。
H30〜R2年度:JPMXP0618217493
R4年度:JPMXP0622717006
R5年度:JPMXP0723833149
R6~R8年度:JPMXP0724020288

共同研究課題一覧

■ 令和8年度共同研究

  共同研究者所属機関   研究課題名称 
群馬大学
生体調節研究所代謝疾患医科学分野
膵β細胞機能低下の分子機構および制御ネットワークの解明
和歌山県立医科大学
動物実験施設
ポリコーム群 PHC2 の exitron スプライシングによるエピジェネティック制御の再編とその生物学的意義の解明
弘前大学 大学院医学研究科 非肥満型 2 型糖尿病モデル Goto- Kakizaki ラット膵島細胞の分化転換/脱分化の検討
九州大学 大学院薬学研究院 末梢神経損傷後に脊髄ミクログリアがCD11c 陽性化するメカニズムの解明
日本医科大学 医学部
生化学・分子生物学(代謝・栄養学)
コレステロール動態による炎症・ウイルス制御機構の解明
神奈川県立がんセンター
がん治療学部
膵癌における全身性腫瘍免疫抑制メカニズムの解明
群馬大学 未来先端研究機構 C 末端領域欠損 RNA ポリメラーゼ IIによる異常転写の解明
東北大学
大学院 医学系研究科
B 細胞リンパ腫発症における転写因子機能解析
東北大学
大学院 医学系研究科 
生物化学分野
転写因子BACH1 が制御する癌細胞可塑性のエピジェネティクス解析
10 国立循環器病研究センター・研究所  分子薬理部 難治性心疾患の病態進展および予後改善を規定する因子の探索的研究
11 熊本大学
泌尿器科学
遺伝性腎癌の空間的不均一性に着目した腫瘍化機構の解明と新規治療戦略の確立
12 熊本大学
国際先端医学研究機構
脳—腸管連関の制御による革新的骨髄移植技術の開発
 

共同利用について

本拠点では共同利用として、学内外の研究者を対象としたシングルセルRNA-seqの受託解析を行っています。

令和5年度 受託解析の詳細や申込方法は、こちらをご覧ください。

 

解析機器について

本拠点では、以下の機器などを用いて共同利用・共同研究を推進しています。

【主な解析機器】 ※( )内は機器帰属
 単一細胞解析装置:フリューダイム社C1(免疫学)
 単一細胞解析装置:10Xゲノミクス社Chromium(エピゲノム解析センター)
次世代シーケンサー:イルミナ社NextSeq 500(共用機器)

次世代シーケンサー:イルミナ社MiSeq(共用機器)

微量電気泳動システム:アジレント社Agilent 2100 バイオアナライザー(免疫学)
細胞分離装置:ベクトン・ディッキンソン社FACSAria II 2台(免疫学、セローム解析センター)
ラージメモリ解析サーバー:ナベインターナショナル社Takeru Large-Memory Server V(免疫学・バイオインフォマティクス解析センター)
解析サーバー:ナベインターナショナル社TAKERU for sequencer III(免疫学・バイオインフォマティクス解析センター)
密閉式超音波破砕装置:Diagenode社Picoruptor(免疫学)
自動磁気細胞分離装置:ミルテニーバイオテク社autoMACS Pro Separator(免疫学)
高速セルソーター:ベックマン・コールター社MoFlo Astrios EQ/EQs(セローム解析センター)
質量分析装置:サーモフィッシャーサイエンティフィック社Q Exactive HF(プロテオーム解析センター)
質量分析装置:サーモフィッシャーサイエンティフィック社Q Exactive(プロテオーム解析センター)
質量分析装置:サーモフィッシャーサイエンティフィック社Orbitrap Elite(プロテオーム解析センター)

お問合せ先

事 務 担 当:横浜市立大学先端医科学研究センター「共同利用・共同研究拠点」運営事務局
T  E  L :045-787-2529
E - m a i l :kyoudou@yokohama-cu.ac.jp

施設および機能