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バイオインフォマティクス解析室

バイオインフォマティクス解析室

バイオインフォマティクス解析室の概要

ライフサイエンスと情報科学とが融合した解析を行う研究施設です。マイクロアレイ、RNA-Seq、全ゲノムクロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)や質量分析などの網羅的な解析技術の発展に伴って必要となる発現プロファイリング、クラスタリング、アノテーション、大量のデータを視覚的に表現する手法などを駆使して先端医科学研究を行っている各研究者の支援を行います。
 
■室長 田村 智彦(免疫学 教授)
■専任教員 中林 潤
先端医科学研究センター バイオインフォマティクス 准教授
E-mail:nakabaya@yokohama-cu.ac.jp
福浦キャンパス 先端医科学研究センター P404

マイクロアレイ、RNA-Seq、全ゲノムクロマチン免疫沈降シーケンス(ChIP-Seq)や質量分析などの網羅的な解析技術の発展に伴って必要となる発現プロファイリング、クラスタリング、アノテーション、大量のデータを視覚的に表現する手法などを駆使して先端医科学研究を行っている各研究者の支援を行います。

設備等

解析用サーバTAKERU for Sequencer Ⅲ
TAKERU Large-Memory Server V

バイオインフォマティクス研究室掲示板について

 準備中

バイオインフォマティクスツールポータル

本解析室で利用できるツールを紹介しています。

バイオインフォマティクス研究会について

イノベーションシステム整備事業の一環として、拠点におけるバイオインフォマティクス解析の情報提供や啓発を行うため、平成24年度より研究会を開催してきました。
また、バイオインフォマティクスを推進し、実験研究者への普及を図るため、今年度は全5回にわたってバイオインフォマティクス解析実習を開講します。
1人1台のパソコンを使用し、実習と講義を取り混ぜたカリキュラムで学びます。

バイオインフォマティクス実習コース概要

講 師:中林 潤 (横浜市立大学 先端医科学研究センター バイオインフォマティクス解析室 准教授)
    藩 龍馬 (横浜市立大学 医学部 免疫学 助教)
会 場:福浦キャンパス 看護棟 M402 情報処理室 (横浜市金沢区福浦3-9 シーサイドライン 市大医学部駅下車)
定 員:30名(先着順)

※実習をお申込みいただいた方は、過去の実習スライドを閲覧することができます。ログインパスワードは、お申し込み後に事務局からお知らせします。
お問い合わせ先

バイオインフォマティクス研究会
事務担当:研究企画・産学連携推進課 戦略研究担当 山崎
TEL:045-787-2529 (内線2514)
E-mail:ycu_bi00@yokohama-cu.ac.jp

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