- 平成03年07月01日 医学部附属病院として開院
- 平成08年04月01日 特定機能病院に承認される
- 平成10年03月20日 神奈川県から災害拠点病院に承認される
- 平成11年08月01日 特定機能病院の辞退
- 平成13年01月01日 特定機能病院に承認される
- 平成14年01月21日 日本医療機能評価機構から病院機能評価Ver.3.1にて認定を受ける
- 平成17年01月18日 厚生労働省から地域周産期母子医療センターに認定される
- 平成17年04月01日 公立大学法人横浜市立大学附属病院として開院
- 平成19年01月21日 日本医療機能評価機構から病院機能評価Ver.5.0にて認定を受ける
- 平成19年01月31日 厚生労働省からがん診療について（地域がん診療連携拠点病院）に指定される
- 平成19年05月08日 神奈川県からエイズ治療の中核拠点病院に指定される
- 平成20年08月02日 WHOとユニセフから赤ちゃんにやさしい病院に認定される
- 平成25年01月01日 横浜市認知症疾患医療センターの設置
- 平成26年03月27日 神奈川DMAT指定病院に指定される
- 平成27年04月10日 横浜市小児がん連携病院に指定される
- 平成28年03月31日 神奈川DMAT-L指定病院に指定される
- 平成29年01月21日 日本医療機能評価機構から病院機能評価3rdG:Ver1.1にて認定を受ける
- 平成30年02月19日 横浜市乳がん連携病院に指定される
- 平成30年04月01日 神奈川県から肝疾患診療連携拠点病院に指定される
- 平成31年04月01日 神奈川県から難病医療連携拠点病院に指定される
- 令和02年04月01日 地域がん診療連携拠点病院（高度型）に指定される
- 令和04年01月21日 日本医療機能評価機構から病院機能評価3rdG：Ver.2.0にて認定を受ける
- 令和04年02月01日 臨床検査部、輸血・細胞治療部、病院診断科・病理部がISO15189：2012基準認定施設に拡大更新認定される
- 令和05年04月01日 厚生労働省からがんゲノム医療拠点病院に指定される
